电子设备的电磁兼容性能让设备在杂乱的电磁环境中正常运行，同时对其他设备不会产生不能忍受的电磁干扰的能力。电子寄存柜的主要控制板上就有很多的芯片和集成电路，能阻挡其他设备的电磁干扰，例如对讲机和手机的干扰，保证寄存工作的正常运行。
寄存柜发展向数字化和网络化快速发展，当一些电子、电器设备正常工作时，会产生一些有用的和没用的电磁能量，这些能量会影响电子寄存柜，杂乱的电磁环境导致电子寄存柜的系统出现问题，所以需要电子寄存柜有较好的电磁兼容性。
关于电磁兼容，有中国电磁兼容认证EMC（3C认证的一部分），CE电磁兼容认证（CE认证的一部分）等。通过电磁兼容认证的电子存包柜品质性能更有保障。电子寄存柜的电子兼容性就是我们挑选寄存柜时的一个标准。
